banner
Дом / Новости / Множественные митогеномы указывают на то, что все разваливается с гипотезами филогеографической эволюции медоносных пчел (Apis mellifera) из Африки или Азии.
Новости

Множественные митогеномы указывают на то, что все разваливается с гипотезами филогеографической эволюции медоносных пчел (Apis mellifera) из Африки или Азии.

Oct 19, 2023Oct 19, 2023

Научные отчеты, том 13, Номер статьи: 9386 (2023) Цитировать эту статью

Подробности о метриках

Предыдущие морфомолекулярные исследования эволюционных взаимоотношений внутри экономически важного рода медоносных пчел (Apis), включая западную медоносную пчелу (A. mellifera L.), предположили, что они возникли из Африки или Азии и с последующим распространением в Европу. Я проверяю эти гипотезы с помощью метаанализа полных кодирующих областей митохондриальной ДНК (11,0 т.п.н.) из 22 номинальных подвидов, представленных 78 отдельными последовательностями у A. mellifera. Анализ экономности, расстояния и правдоподобия идентифицирует шесть вложенных кладов: «Вещи разваливаются» с гипотезами «из Африки» или «Азия». Филогеографический анализ, калиброванный по молекулярным часам, вместо этого показывает базальное происхождение A. m. mellifera в Европе ~ 780 тыс. лет назад и распространение в Юго-Восточную Европу и Малую Азию ~ 720 тыс. лет назад. Евразийские пчелы распространились на юг через левантийский/нилотский/аравийский коридор в Африку ~ 540 тыс. лет назад. Африканская клада, восстановленная в Иберии примерно через 100 тыс. лет назад, распространилась после этого на острова западного Средиземноморья и обратно в Северную Африку. Номинальные подвиды в пределах малоазиатских и средиземноморских клад менее дифференцированы, чем особи внутри других подвидов. Имена имеют значение: парафилетические аномалии являются результатом неправильного отнесения последовательностей в GenBank к неправильному подвиду или использования ошибочных последовательностей, которые выясняются путем включения нескольких последовательностей из доступных подвидов.

Род Apis включает не менее десятка номинальных видов медоносных пчел, встречающихся в Азии, Африке, на Ближнем Востоке и в Европе, включая типовой вид A. mellifera L., Западная медоносная пчела (Таблица 1)1,2. Хотя несколько видов играют важную роль в качестве традиционных местных источников меда, исторически для этой цели были одомашнены только два вида, гнездящихся в полостях: A. cerana в Индии и A. mellifera. Пчеловодство A. mellifera зарегистрировано в Египте еще в 2600 г. до н.э.3. (Ссылки на Левант как на «землю молока и меда» (Исход 3:8) вместо этого могут относиться к сиропу из оазисных фиников, опыляемых ветром и (или) вручную (Phoenix dactylifera) еще большей древности3). A. mellifera транспортируется людьми по всему миру в качестве основного коммерческого источника меда и пчелиного воска, а также имеет особое сельскохозяйственное значение в Америке как интродуцированный опылитель некоторых овощных и фруктовых культур, которые сами по себе интродуцированы4. Конкуренция между интродуцированными медоносными пчелами широкого профиля и местными специализированными насекомыми-опылителями (включая других пчел, не относящихся к апинам) за пыльцу («кража пыльцы») может нанести ущерб местным видам растений5. Известно, что этому влиянию способствуют географические различия между различными местными штаммами или подвидами A. mellifera, а также качество и количество меда и другие особенности поведения6. Примечательно, что так называемые «африканизированные» пчелы возникли в результате побега африканских подвидов, скрещенных с одомашненными южноамериканскими ульями, где гибриды сочетают повышенный выход меда с большей агрессивностью и представляют опасность для человека7.

Морфо-поведенческая систематика выделила три группы видов внутри рода: карликовые медоносные пчелы (A. florea и A. andreniformis), гигантские медоносные пчелы (A. Laboriosa, A. dorsata и A. breviligula) и гнездящиеся в полостях медоносные пчелы. (A. mellifera вместе с A. nuluensis, A. nigrocincta, A. cerana (включая A. indica) и A. koschevnikovi). A. mellifera — единственный вид, имеющий естественный ареал в Африке и Европе, и включает более 30 номинальных подвидов2. Исторически они были сгруппированы в четыре континентальные группы, обозначенные как ACMO для африканского, континентального, меллиферного и восточного распространения8. Географическое происхождение и эволюционное распространение этих групп остается спорным, как и их разделение на филогенетические линии предков-потомков. Молекулярные исследования, основанные на анализе различных компонентов ядерного генома (см. «Обсуждение»), в целом сходятся во мнении о их перегруппировке в основу MAOC, основанной на предложении альтернативных теорий происхождения: «Трижды из Африки»9 [корень в A] или «Трижды из Азии»10 [корень между A и O]. Эти исследования основаны на менее чем дюжине доступных подвидов A. mellifera. Другие филогеографические выводы были сделаны на основе анализа полных геномов митохондриальной ДНК (мтДНК) из отдельных последовательностей каждого подвида11,12. В частности, Тихелька и его коллеги в этом журнале12 недавно представили метаанализ мтДНК, основанный на значительном объеме данных Бордмана и др.11 и новых методах филогенетического вывода. Они пришли к еще одной альтернативной гипотезе — ближневосточному/североафриканскому происхождению A. mellifera.

 94% of bootstraps. Analyses with the NJ and ML methods give identical branching orders and substantially similar bootstrap support. Within Apis, the Dwarf Honey Bee pair [A. florea + A. andreniformis] is the outgroup to the remaining taxa. Within the Cavity-Nesting species, A. mellifera is the sister species to the others, and its phenetic difference from other cavity-nesting species is greater than that between the Dwarf and Giant Honey Bee pairs. Figure 1b shows the MP analysis of Apis species alone including ten subspecies of Apis mellifera: A. m. mellifera is sister to the remaining subspecies. Note that A. florea and A. mellifera, the only species whose native ranges overlap in the Middle East, are in separate morpho-behavioral and molecular clades./p> 95%. Maximum pairwise patristic differences between subspecies sequences (5–10) are also less than those within A. m. ligustica./p> 99%. The mainland European variant is basal to the North African variants, and the two island variants are paired. Maximum pairwise differences between subspecies sequences (3 ~ 25) are less than those within A. m. ligustica or A. m. jemenitica./p> 100 Kya, notably among multiple replicates of A. m. ligustica and A. m. jemenitica, 120 Ka and 150 Ka, respectively. Differences among other nominal subspecies originate only a few 10 s of Kya, notably the Asia Minor forms (A. m. meda, A. m. caucasia, and A. m. anatoliaca, 10–20 Ka) and Mediterranean species including insular forms (A. m. ruttneri and A. m. siciliana, 40 Kya)./p> 100 Kya, whereas difference between Asia Minor and insular Mediterranean subspecies date to only a few 10 s of Kya./p>